Affected Genes - Ontology Breakdown - Gene Enrichment - Proteome Analysis
These are the micro-array results of a differential gene expression
microarray experiments and the subsequent analysis steps performed on
them. The up/down- regulation ratio was obtained by
measuring WT cells against MK5 activated cells. See material and methods for technical
information as well as the data usage policy.
MK5 Proteome Analysis
Table 3: Type II network, divided ranks. This table presents the output of the
simulation of a type-II network in which we relied on the high
confidence interactions and micro-array results. The output of the
micro-array was then ranked and these ranks used as input into the
network simulation. After performing two such simulations (one for the
MK5 off and one for the MK5 on microarray output), we divided the
ranks and sorted the results accordingly. The output of this
technique is a collection of proteins that cluster naturally
together.
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